Wilayah Kabupaten Buton terletak di Kepulauan Buton (Pulau Buton), jazirah tenggara Pulau Sulawesi. Secara geografis terletak di bagian selatan garis khatulistiwa, memanjang dari Utara ke Selatan diantara 4,960-6,250 Lintang Selatan dan membentang dari Barat ke Timur diantara 120,000-123,340 Bujur Timur. Secara administratif batas-batas Kabupaten Buton adalah sebagai berikut :
- Sebelah Utara berbatasan dengan Kabupaten Muna dan Buton Utara;
- Sebelah Selatan berbatasan dengan Buton Selatan;
- Sebelah Timur berbatasan dengan Kabupaten Wakatobi; dan
- Sebelah Barat berbatasan dengan Kota Baubau.
